Com registro de entradas e saídas, controle de validade com uso prioritário do lote mais antigo, organização física que separe o que está em uso do estoque e conferência periódica.
A rastreabilidade de lote é o que liga o estoque ao paciente atendido.
Fontes oficiais desta resposta
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RDC Anvisa nº 63, de 25 de novembro de 2011 — Anvisa.
Dispõe sobre os requisitos de boas práticas de funcionamento para os serviços de saúde.
Consultar no site oficial
Vale para o seu caso?
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.