Em quatro grandes grupos. O Grupo I reúne as atividades relacionadas a produtos de interesse da saúde (indústria, distribuição, comércio e serviços com produtos). O Grupo II reúne a prestação de serviços de saúde — é onde ficam clínicas, laboratórios e hospitais. O Grupo III reúne as demais atividades relacionadas à saúde, incluindo serviços coletivos e sociais, serviços veterinários e outras atividades relacionadas. O Grupo IV trata da promoção de programas de saúde.
Dentro de cada grupo há subgrupos e agrupamentos numerados, o que ajuda a localizar a atividade quando você não sabe o código exato.
Fontes oficiais desta resposta
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Portaria CVS nº 1, de 5 de janeiro de 2024 — Centro de Vigilância Sanitária – Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo.
Disciplina, no âmbito do Sistema Estadual de Vigilância Sanitária (Sevisa), o licenciamento sanitário dos estabelecimentos de interesse da saúde e das fontes de radiação ionizante. Texto atualizado integralmente em 17/09/2024. Anexo I: atividades e classificação de risco; Anexo IV: relação de documentos.
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Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.