O que a norma exige é a separação entre área suja e área limpa com fluxo direcionado. A forma construtiva depende do porte e do volume: pode ser sala própria ou ambiente de processamento com barreira física entre os setores.
O que não é aceito é limpar instrumental contaminado na mesma bancada onde se embala material limpo, sem barreira. O projeto físico define a solução, avaliada no LTA.
Fontes oficiais desta resposta
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RDC Anvisa nº 15, de 15 de março de 2012 — Anvisa.
Dispõe sobre requisitos de boas práticas para o processamento de produtos para saúde (limpeza, desinfecção e esterilização).
Consultar no site oficial -
RDC Anvisa nº 50, de 21 de fevereiro de 2002 — Anvisa.
Regulamento técnico para planejamento, programação, elaboração e avaliação de projetos físicos de estabelecimentos assistenciais de saúde.
Consultar no site oficial
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.