O que a norma exige é a separação entre a área suja e a área limpa, com fluxo direcionado, e ambientes compatíveis com o volume e o tipo de material processado. A RDC 15/2012 trata dos requisitos de boas práticas para o processamento de produtos para saúde, incluindo os centros de material e esterilização.
Em clínicas pequenas é comum a solução de um ambiente de processamento com bancada dividida em setor sujo e setor limpo, com barreira física entre eles. A configuração aceitável depende da atividade e é definida no projeto.
Fontes oficiais desta resposta
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RDC Anvisa nº 15, de 15 de março de 2012 — Anvisa.
Dispõe sobre requisitos de boas práticas para o processamento de produtos para saúde (limpeza, desinfecção e esterilização).
Consultar no site oficial -
RDC Anvisa nº 50, de 21 de fevereiro de 2002 — Anvisa.
Regulamento técnico para planejamento, programação, elaboração e avaliação de projetos físicos de estabelecimentos assistenciais de saúde.
Consultar no site oficial
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.