Muda bastante. A manipulação de preparações estéreis exige ambiente com controle de contaminação, procedimentos e validações próprios, num patamar muito superior ao das formas não estéreis.
A RDC 67/2007 trata das boas práticas de manipulação, e as exigências específicas para estéreis constam da regulamentação aplicável a essa atividade. Antes de incluir esse serviço, avalie a viabilidade estrutural.
Fontes oficiais desta resposta
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RDC Anvisa nº 67, de 8 de outubro de 2007 — Anvisa.
Boas práticas de manipulação de preparações magistrais e oficinais para uso humano em farmácias.
Consultar no site oficial -
RDC Anvisa nº 50, de 21 de fevereiro de 2002 — Anvisa.
Regulamento técnico para planejamento, programação, elaboração e avaliação de projetos físicos de estabelecimentos assistenciais de saúde.
Consultar no site oficial
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.