A RDC 67/2007 organiza a farmácia em áreas com finalidade definida: dispensação e atendimento, armazenamento, pesagem, manipulação, controle de qualidade, lavagem de utensílios e paramentação, entre outras, conforme as formas farmacêuticas preparadas.
A configuração exata depende do que a farmácia manipula — e é isso que o projeto avaliado pela Vigilância precisa demonstrar.
Fontes oficiais desta resposta
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RDC Anvisa nº 67, de 8 de outubro de 2007 — Anvisa.
Boas práticas de manipulação de preparações magistrais e oficinais para uso humano em farmácias.
Consultar no site oficial -
RDC Anvisa nº 50, de 21 de fevereiro de 2002 — Anvisa.
Regulamento técnico para planejamento, programação, elaboração e avaliação de projetos físicos de estabelecimentos assistenciais de saúde.
Consultar no site oficial
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.