Depende do zoneamento do município e da zona específica. Muitas zonas residenciais admitem atividades de pequeno porte, incluindo consultórios, com restrições de área, horário e geração de tráfego. Outras não admitem.
A consulta de viabilidade responde isso de forma oficial. Confie nela, não na informação de que "tem outra clínica na mesma rua" — a outra pode estar irregular ou ter direito adquirido.
Fontes oficiais desta resposta
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Lei Complementar federal nº 123, de 14 de dezembro de 2006 — Congresso Nacional.
Estatuto Nacional da Microempresa e da Empresa de Pequeno Porte; o art. 55 trata dos critérios de fiscalização e licenciamento.
Consultar no site oficial
Vale para o seu caso?
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.