Em sala comercial, o uso de sanitário de pavimento é uma realidade e pode ser aceito, desde que declarado no projeto e desde que o conjunto atenda aos requisitos da atividade e da acessibilidade.
O que costuma inviabilizar é a atividade que exige sanitário dentro do próprio estabelecimento — por exemplo, quando há preparo de paciente, coleta de material ou permanência prolongada. A resposta vem do programa de ambientes da atividade.
Fontes oficiais desta resposta
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RDC Anvisa nº 50, de 21 de fevereiro de 2002 — Anvisa.
Regulamento técnico para planejamento, programação, elaboração e avaliação de projetos físicos de estabelecimentos assistenciais de saúde.
Consultar no site oficial -
ABNT NBR 9050 — Acessibilidade a edificações, mobiliário, espaços e equipamentos urbanos — Associação Brasileira de Normas Técnicas.
Norma técnica de acessibilidade referenciada pela legislação; define parâmetros de rota acessível, sanitários, circulação e sinalização.
Consultar no site oficial
Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.