Precisa, quando situado em endereço diverso. A Portaria CVS 1/2024 determina que o almoxarifado que armazena produtos sujeitos ao controle sanitário para uso próprio das unidades do estabelecimento assistencial necessita de licença específica nesse caso.
A licença é emitida com a razão social e a atividade econômica do estabelecimento vinculado — incluindo o CNAE 8640-2/02 — e traz os dados do almoxarifado: CNPJ de filial, tipo de serviço e endereço.
Fontes oficiais desta resposta
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Portaria CVS nº 1, de 5 de janeiro de 2024 — Centro de Vigilância Sanitária – Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo.
Disciplina, no âmbito do Sistema Estadual de Vigilância Sanitária (Sevisa), o licenciamento sanitário dos estabelecimentos de interesse da saúde e das fontes de radiação ionizante. Texto atualizado integralmente em 17/09/2024. Anexo I: atividades e classificação de risco; Anexo IV: relação de documentos.
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Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.