É o registro sistemático da movimentação de substâncias e medicamentos sujeitos a controle especial: entradas, saídas, perdas e estoque. A obrigação decorre da Portaria SVS/MS 344/1998.
A forma de escrituração e os prazos de envio de informações às autoridades dependem do tipo de estabelecimento e das normas vigentes da Anvisa. Estabelecimentos farmacêuticos têm obrigações específicas de transmissão eletrônica.
Fontes oficiais desta resposta
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Portaria SVS/MS nº 344, de 12 de maio de 1998 — Ministério da Saúde / Anvisa.
Aprova o regulamento técnico sobre substâncias e medicamentos sujeitos a controle especial; as listas do Anexo I são atualizadas periodicamente pela Anvisa.
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Esta resposta explica a regra geral. Exigência sanitária depende do CNAE, do município e do que a clínica realmente faz — por isso a mesma pergunta pode ter respostas diferentes em duas cidades. Conte a sua situação e dizemos o que se aplica a você.